若按最好大学版排行榜看，首都医科大学2018年综合实力排名第46位；2017年综合实力排名第42位；2016年综合实力排名第53位；2015年综合实力排名第55位。以下是首都医科大学综合实力排名表：
| 年份 | 排名 | 院校 | 所在地 | 新生高考成绩得分 | 毕业生就业率 |
|---|---|---|---|---|---|
| 2018 | 46 | 首都医科大学 | 北京 | 72.7 | 94.80% |
| 2017 | 42 | 首都医科大学 | 北京 | 71.0 | 94.90% |
| 2016 | 53 | 首都医科大学 | 北京 | 72.2 | 96.30% |
| 2015 | 55 | 首都医科大学 | 北京 | 66.4 | 96.30% |
若按金平果版排行榜看，首都医科大学2018年全国本科院校排名第81位；2017年全国本科院校排名第63位；2016年全国本科院校排名第58位；2017年全国本科院校排名第44位。以下是首都医科大学历年排名整理表：
| 年份 | 排名 | 院校 | 所在地 | 省排名 |
|---|---|---|---|---|
| 2018 | 81 | 首都医科大学 | 北京 | 16 |
| 2017 | 63 | 首都医科大学 | 北京 | 13 |
| 2016 | 58 | 首都医科大学 | 北京 | 12 |
| 2015 | 44 | 首都医科大学 | 北京 | 9 |