按校友会版排行榜看，杭州医学院2018年全国排名第706位；2017年全国排名第712位。以下是杭州医学院历年排名整理表：
| 年份 | 排名 | 院校 | 星级 | 所在地 | 类型 | 办学类型 | 办学层次 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2018 | 706 | 杭州医学院 | 1 | 浙江 | 医药 | 应用型 | 区域知名大学 |
| 2017 | 712 | 杭州医学院 | 1 | 浙江 | 医药 | 应用型 | 区域知名大学 |
若按金平果版排行榜看，杭州医学院2018年全国本科院校排名第746位；2017年全国本科院校排名第642位；2016年全国专科院校排名第343位；2017年全国专科院校排名第752位。以下是杭州医学院历年排名整理表：
| 年份 | 排名 | 院校 | 所在地 | 省排名 |
|---|---|---|---|---|
| 2018 | 746 | 杭州医学院 | 浙江 | 32 |
| 2017 | 642 | 杭州医学院 | 浙江 | 28 |
| 2016 | 343 | 浙江医学高等专科学校 | 浙江 | 26 |
| 2015 | 752 | 浙江医学高等专科学校 | 浙江 | 33 |