若按校友会版排行榜看，南京大学金陵学院2018年全国排名第12位；2017年全国排名第9位；2016年全国排名第11位；2017年全国排名第11位；全国排名第11位；2013年全国排名第13位。以下是南京大学金陵学院历年排名整理表：
| 年份 | 排名 | 院校 | 星级 | 所在地 | 类型 | 办学类型 | 办学层次 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2018 | 12 | 南京大学金陵学院 | 6 | 江苏 | 应用型 | 中国顶尖独立学院 | |
| 2017 | 9 | 南京大学金陵学院 | 5 | 江苏 | 综合 | 应用型 | 中国一流独立学院 |
| 2016 | 11 | 南京大学金陵学院 | 5 | 江苏 | 应用型 | 中国一流独立学院 | |
| 2015 | 11 | 南京大学金陵学院 | 5 | 江苏 | 综合 | 应用型 | 中国一流独立学院 |
| 2014 | 11 | 南京大学金陵学院 | 4 | 江苏 | 应用型 | 中国高水平独立学院 | |
| 2013 | 13 | 南京大学金陵学院 | 江苏 |
若按金平果版排行榜看，南京大学金陵学院2018年全国独立学院排名第47位；2017年全国独立学院排名第41位；2016年全国独立学院排名第26位；2017年全国独立学院排名第23位；全国独立学院排名第12位。以下是南京大学金陵学院历年排名整理表：