2018中国大学排行榜中，吉林医药学院的排名情况是：
[1]在中国高校700强中，吉林医药学院排名第590名，相对于2017年排名下降了25名。
[2]在吉林所有高校中，吉林医药学院排名第20名，相对于2017年排名下降了 1名。
[3]在所有医科类大学中，吉林医药学院排名第71名，相对于2017年排名保持不变。
| 吉林医药学院历年排名表 | |||||
| 年度 | 全国排名 | 省内排名 | 分类 | 分类排名 | 总分 |
| 2018 | 590 | 20 | 医科 | 71 | 60.31 |
| 2017 | 615 | 21 | 医科 | 71 | 60.23 |
| 2016 | 573 | 18 | 医科 | 65 | 60.39 |
| 2015 | 592 | 19 | 医科 | 62 | 60.38 |
| 2014 | 683 | 22 | 医科 | 62 | 60.03 |
| 2013 | 511 | 13 | 医科 | 54 | 60.03 |
| 2012 | 500 | 12 | 医科 | 50 | 0.07 |